傳統上,環狀 DNA 被認為*存在于原核生物以及部分病毒當中,在真核生物當中,*有半自主細胞器線粒體和葉綠體當中具有環狀 DNA。1964年,伊利諾伊大學的 Yasuo Hotta 和 Alix Bassel 卻在小麥的胚和公豬**當中發現了環狀 DNA,證明了這種看似結構怪異的 DNA 在高等植物和哺乳動物中亦存在。從 1960 年代至今的半個多世紀里,研究者已經在幾乎所有的物種當中發現環狀 DNA 的蹤跡。因為這些環狀 DNA 存在于染色體之外,因此也得名“染色體外環狀 DNA”( extrachromosomal circular DNA,簡稱 eccDNA) 。近年來,得益于分離純化以
m6A修飾是一種可逆的RNA修飾類型,也是目前RNA中研究*清楚的一種修飾方式。有關RNA m6A修飾*早的研究報道在1974年,隨后在各物種中被發現,m6A修飾幾乎在所有RNA代謝過程中發揮重要作用。目前針對m6A RNA甲基化的研究仍然如火如荼。近幾月,有關m6A RNA甲基化修飾的高分文章依舊層出不窮,多篇文章報道了m6A在各個研究方向的機制。那么有哪些具體的進展?有哪些新的方法思路?小編匯集了1月至今這四個月的多篇m6A RNA修飾高分文章,帶大家把握這一領域的**研究進展。
該文以METTL14為研究對象,發現其可通過m6A修飾介導circORC5調節miR-30c-2-3p/AKT1S1 axis抑制胃***生長,并可能為GC提供潛在的**靶點。本文當中涉及到的m6A-MeRIP高通量篩選、RNA-seq、MeRIP-PCR、RIP-seq、m6A整體甲基化水平檢測(LC-MS/MS)等實驗,云序生物均可提供技術服務。
m6A或其他修飾MeRIP測序之后經常會需要通過一種“可視化”方法,直觀考察以及展示到文章中個別基因或區域的測序原始信號(coverage)和序列比對情況,即展示甲基化峰。類似的可視化展示也常常應用在一些其他的需要分析信號峰的測序中,如MeDIP-seq、ChIP-seq、ATAC-seq等。**為大家逐步詳細介紹用IGV軟件進行甲基化峰可視化的操作方法,其中也囊括了一些常見問題的解答 。
近幾月,有關m6A RNA甲基化修飾的高分文章依舊層出不窮,多篇文章報道了m6A在各個研究方向的機制。那么有哪些具體的進展?有哪些新的方法思路?小編匯集了9月至今這三個多月的多篇m6A RNA修飾高分文章,帶大家把握這一領域的*新進展。