m6A修飾是一種可逆的RNA修飾類型，也是目前RNA中研究*清楚的一種修飾方式。有關RNA m6A修飾*早的研究報道在1974年，隨后在各物種中被發現，m6A修飾幾乎在所有RNA代謝過程中發揮重要作用。目前針對m6A RNA甲基化的研究仍然如火如荼。
近幾月，有關m6A RNA甲基化修飾的高分文章依舊層出不窮，多篇文章報道了m6A在各個研究方向的機制。那么有哪些具體的進展？有哪些新的方法思路？小編匯集了9月至今這三個多月的多篇m6A RNA修飾高分文章，帶大家把握這一領域的*新進展。
m6A近期高分文章匯總
高分文章展示
1. m6A介導干擾素信號傳導和抗原呈遞
發表期刊：Cancer Discovery
影響因子：38.272
發表時間：2021.10.08
文章鏈接：Transcription Elongation Machinery Is a Druggable Dependency and Potentiates Immunotherapy in Glioblastoma Stem Cells
膠質母細胞瘤（GBM）是*具侵襲性和致命性的人類*癥之一，由GBM干細胞（GSCs）促進。受遺傳和表觀遺傳改變驅動的GSC有助于*瘤的持續生長、侵入正常大腦、逃避免疫監視和zhi療抵抗，因此是GBMzhi療的關鍵靶標。本文研究人員在大量患者來源的GSC、分化的膠質母細胞瘤細胞（DGC）和神經干細胞（NSC）中探究基因表達和全基因組CRISPR/Cas9篩選，以確定 GSC 干性的主要調節因子，揭示基本的轉錄狀態隨著 RNA 聚合酶 II 介導的轉錄增加。發現YY1 和轉錄 CDK9 復合物對于體外和體內 GSC 的存活和維持至關重要，可調節 GSC 中的轉錄延伸，并靶向引發 RNA m6A 修飾依賴性干擾素反應，減少調節性 T 細胞浸潤，并增強免疫檢查點zhi療在膠質母細胞瘤中的療效?？偟膩碚f，YY1-CDK9 轉錄延伸復合物定義了一種可靶向的細胞狀態，在膠質母細胞瘤中具有活躍的轉錄、抑制的干擾素反應和免疫zhi療抗性。
圖例：YY1-CDK9復合物通過調節RNA 聚合酶 II介導的轉錄延伸和RNA m6A修飾
2. 對RNA修飾測序進行系統校準的方法
發表期刊：Nature Methods
影響因子：47.99
發表時間：2021.09.30
文章鏈接：Systematic calibration of epitranscriptomic maps using a synthetic modification-free RNA library
在轉錄組中普遍存在的RNA修飾的發現導致了表觀轉錄組學領域的快速發展。近年來，研究人員們設計了多種方法來揭示不同RNA修飾的表觀轉錄組圖譜。但是在實際應用中，效果差強人意，經常存在高假陽性率、低分辨率的問題。不同研究方法下，同一種修飾的位點數甚至能相差2-3個數量級。因此，需要開發一種充分可靠的方法，作為評估表觀轉錄圖譜的標準。因此，中山大學的駱觀正教授團隊提出了一種體外構建全轉錄組無修飾RNA（IVT RNA）文庫的方法，系統地對常用的RNA修飾檢測方法進行評估和校正，提高了修飾位點檢測的準確性，從而獲得高置信度位點信息和定量圖譜。
圖例：IVT RNA文庫校正MeRIP-seq/m6A-seq
3. m6A-seq2方法實現m6A定量分析
發表期刊：Nature Methods
影響因子：47.99
發表時間：2021.09.03
文章鏈接：Multiplexed profiling facilitates robust m6A quantification at site, gene and sample resolution
常用的基于抗體識別m6A的鑒定RNA m6A修飾位點的m6A-seq法，存在一些明顯的缺點：（1）RNA用量大；（2）生物學重復差；（3）無法進行樣本和基因層面的定量分析；（4）實驗成本高?；谶@些不足，研究人員針對其進行優化升級，開發了m6A-seq2：對不同樣本進行標簽化——通過對不同樣本連接特異性的接頭，混合后進行抗體識別與免疫沉淀與建庫，**降低每個樣本RNA的用量，并且由于是同時進行免疫沉淀和建庫，生物學重復性也會明顯提高，同時也會**降低實驗成本。
圖例：m6A-seq與m6A-seq2實驗方法的示意圖比較
4. IGF2BP維持造血干細胞功能
發表期刊：Cell Stem Cell
影響因子：25.269
發表時間：2021.10.21
文章鏈接：Differential m6A RNA landscapes across hematopoiesis reveal a role for IGF2BP2 in preserving hematopoietic stem cell function
m6A是mRNA上*豐富的修飾，在各種生物過程中起著關鍵作用，一些m6A調節因子在正常和惡性造血過程中起關鍵作用，調節星狀細胞命運。因此，建立RNA m6A修飾的全mian景觀，解讀其在不同生理和病理背景下的動態和作用至關重要。然而由于稀少細胞的技術限制，造血系統中的m6A景觀仍是未知狀態。因此，研究人員開發了一種針對稀少的造血干細胞的高度敏感和高效的zhong共輸入m6A測序（SLIM-seq）策略，建立了一個跨造血層次的全mianm6A景觀，并發現IGF2BP2是通過調節線粒體活性維持星狀細胞功能的關鍵因子。
圖例：造血系統m6A景觀及IGF2BP2作用機制
5. FTO緩解心功能障礙
發表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy
影響因子：38.104
發表時間：2021.11.02
文章鏈接：m6A demethylase FTO attenuates cardiac dysfunction by regulating glucose uptake and glycolysis in mice with pressure overload-induced heart failure
m6A參與多種生物過程和疾病，是哺乳動物mRNA*常見的轉錄后修飾。然而它在心力衰竭（HF）期間心臟功能代謝變化中的作用尚不清楚。為此，研究人員探究了m6A去甲基化酶基因 FTO 在壓力過載誘導的心衰期間的代謝中的作用。該研究jing準報道了該基因在心臟功能發揮和結構重塑中的關鍵功能，特別是作用于葡萄糖代謝途徑，揭示了m6A修飾在 HF 期間心臟代謝穩態中作用，表明 FTO 有潛力成為 HF 預防和zhi療靶點。
圖例：FTO調節葡萄糖攝取和糖酵解的模型
6. m6A促進阿爾茲海默癥發展
發表期刊：Molecular Cell
影響因子：19.328
發表時間：2021.10.21
文章鏈接：Interaction of tau with HNRNPA2B1 and N6-methyladenosine RNA mediates the progression of tauopathy
微管相關蛋白tau在健康狀態下能夠穩定微管，但是在壓力和疾病下，如阿爾茲海默癥（AD），會發生寡聚、磷酸化，在軀體樹突枝中積累。Tau蛋白在應激和疾病狀態下的生物學功能仍是未知狀態。研究人員發現tau蛋白的低聚化會招募RNA結合蛋白和m6A修飾的RNA轉錄本，稱為N6-甲基腺苷RNA。這種復合物調節應激反應并抑制蛋白質的合成。在AD及其相關模型中，這種復合物變得持續化和病理化，導致tau蛋白纖維化、核膜破壞和進行性神經衰退性變。HNRNPA2B1下調可降低對病理tau蛋白的反應。m6A隨著人類AD大腦中疾病的嚴重程度逐漸增加。
圖例：m6A與寡聚tau蛋白在人AD腦組織first定位
7. m6A reader IMP2或發揮促結直腸*作用
發表期刊：Journal of Hematology and Oncology
影響因子：23.168
發表時間：2021.11.07
文章鏈接：N6-methyladenosine reader IMP2 stabilizes the ZFAS1/OLA1 axis and activates the Warburg efect: implication in colorectal cancer
越來越多的證據表明m6A調節器參與到結直腸*（CRC）的病因學和進展，但是m6A reader參與糖酵解代謝的確切機制尚未清楚。本文研究人員發現，在CRC中，lncRNA ZFAS1的RGGAC/RRACH元件的+843腺苷位點發生m6A修飾，IMP2與其直接互作，促進ZFS1的RNA穩定，在CRC增殖和進展過程中增加OLA1的招募、ATP的水解以及糖酵解。IMP2和ZFAS1在CRC細胞和配對CRC隊列中明顯過表達，m6A水平升高（n=144），這些指標可以是CRC預后預測的chao低生物標志物。IMP2調控ZFAS1表達，增強CRC細胞增殖、集落形成和凋亡抑制，具有致*作用。
圖例：IMP2穩定的ZFAS1通過促進OLA1的ATP酶活性來促進結直腸*進展
云序生物m6A修飾研究五大模塊
01 m6A RNA修飾測序
m6A RNA修飾測序（m6A-meRIP-seq）
對m6A RNA甲基化，目前*流行的檢測手段為m6A-MeRIP-Seq技術，適用于m6A RNA甲基化譜研究，快速篩選m6A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多種非編碼RNA的m6A測序：
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m6A 全轉錄組測序（涵蓋mRNA，LncRNA，circRNA）
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m6A LncRNA測序（涵蓋LncRNA和mRNA）
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m6A Pri-miRNA測序（涵蓋Pri-miRNA和mRNA）
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m6A mRNA測序
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m6A miRNA測序
02 檢測整體m6A RNA修飾水平
LC-MS/MS檢測整體RNA修飾水平
*高高效，可以實現一次檢測，9類修飾水平檢測，一步到位。
比色法檢測整體RNA修飾水平
快速檢測m6A整體甲基化水平
03 m6A RNA修飾上游酶的篩選
m6A RNA修飾相關酶PCR芯片
尋找上游直接調控m6A RNA甲基化的甲基轉移酶。
04 m6A RNA修飾靶基因驗證
MeRIP-qPCR
云序提供各類不同修飾的meRIP-qPCR服務，可針對mRNA，lncRNA，環狀RNA等不同類型的RNA分子進行檢測，低通量驗證RNA修飾靶基因表達水平。
05機制互作研究
5.1 RIP-seq/qPCR
篩選或驗證RNA修飾直接靶點，研究RNA修飾靶基因的調控機制。
5.2 RNA pull down -MS/WB
篩選或驗證目標RNA互作基因或蛋白，研究相應的分子調控機制。
5.3 雙熒光素酶實驗
驗證兩基因互作，研究相應的分子調控機制。
5.4ChIP-seq
篩選或驗證目標蛋白與DNA互作，研究相應的分子調控機制。
云序生物服務優勢
優勢一：發表10分以上文章*多的m6A RNA甲基化測序服務平臺。云序已累計支持客戶發表52+篇高水平文章，合計影響因子450分+，是國內支持發文*多、累計影響因子*高的公司。
優勢二：至今完成4000+例 m6A測序樣本，全mian覆蓋醫口、農口等各類樣本。
優勢三：全mian檢測mRNA和各類非編碼RNA（circRNA，lncRNA，Pri-miRNA等）。
優勢四：du家提供m6A一站式服務：m6A整體水平檢測、m6A測序、MeRIP-qPCR驗證、RIP和RNA pull-down等。
優勢五：率先研發超微量MeRIP測序技術，RNA量低至500ng起。
優勢六：國內*全的RNA修飾測序平臺，提供m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、O8G、ac4C乙?；?'-O-甲基化測序。
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