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    表觀遺傳學研究
    ctDNA羥甲基化測序
    日期:2019年07月15日    來源:云序生物

    新型腫 瘤標志物篩選利器-----ctDNA羥甲基化測序

    cfDNA(Cell free DNA)是人體組織排放到血液、尿液或腦脊液等循環體系中的降解的DNA小片段,是一種新型的分子標記物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指來源于腫 瘤細胞的cfDNA,是液體活檢主流方向。
    報道表明:ctDNA羥甲基化不僅可以作為腫 瘤分子標志物,還可用于追溯腫 瘤細胞的組織來源。在醫療大趨勢下,ctDNA羥甲基化檢測既具有極高的科研價值,又具備推進醫療臨床實踐的巨大潛能,為實現腫 瘤臨床治 療的全病程管理提供強有力的支持。利用ctDNA羥甲基化測序,僅憑一管液體就可以進行腫 瘤診斷、療效評估、實時監控、個體化用藥、預測復發等,是里程碑式的新型液體活檢技術。
    云序生物率先推出ctDNA羥甲基化測序服務,低僅需1ng ctDNA既可進行測序??蛻魞H需提供血漿,血清或體液樣本,云序生物為您完成從ctDNA提取,文庫制備,上機測序到數據分析整套服務流程。

    ctDNA羥甲基化來源
    圖1. ctDNA羥甲基化來源
    具臨床應用前景的分子標志物-----ctDNA羥甲基化
     ctDNA羥甲基化研究應用范圍
    圖2. ctDNA羥甲基化研究應用范圍
    1.ai癥早篩利器:ctDNA羥甲基化在ai癥早篩領域具有重大研究前景。
    癌癥早篩利器
    2.鑒定ai癥有效手段:ctDNA羥甲基化可區分ai癥,疾病和正常組間存在明顯差異。
        鑒定癌癥有效手段
    3.助力藥 物或其他手段治 療效果評估:在治 療過程中,ctDNA羥甲基化水平與ai細胞數量呈正比,可用于協助評估用藥療效、復發及治 療后期轉移動態的監測。
      助力藥物或其他手段治 療效果評估
    助力藥物或其他手段治 療效果評估助力藥物或其他手段治 療效果評估
    高影響因子文章利器-----ctDNA羥甲基化
    近年來已發表期刊(部分)
    圖3. 近年來已發表期刊(部分)
    高分期刊評語(ctDNA羥甲基化適用于分子標志物)
    圖4. 高影響因子期刊評語(ctDNA羥甲基化適用于分子標志物)
    技術優勢
    一站式服務:客戶只需提供樣本,云序生物為您完成從ctDNA提取,文庫制備,上機測序到數據分析整套服務流程。
    特異性富集ctDNA片段:云序生物具有豐富樣本處理經驗,采用ctDNA提取試劑盒,富集效率高。
    嚴格質控流程:云序生物質控流程嚴格,層層把關,為客戶提供高準確度的結果。
    專業化生物信息分析:云序生物強大生物信息團隊,滿足客戶個性化數據分析要求。

    樣本要求
    1)樣品類型:血清、血漿、體液等。其他樣本類型請詳詢。
    2)樣品量:
    血清,血漿:≥5 mL;
    體液:請詳詢。
    3)樣品保存:
    血清、血漿、體液樣品,可用液氮速凍后-80℃保存,樣品保存期間避免反復凍融。
    4)樣品運輸:樣品置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰運輸。
    案例解析
    案例1:ctDNA羥甲基化可作為人類ai癥診斷的分子標志物
    原文:5-Hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell-free DNA as diagnostic biomarkers for human cancers
    期刊:Cell Research 影響因子:15
    本篇文章的作者是復旦大學華山醫院的劉杰教授課題組與芝加哥大學何川教授課題組合作通過檢測不同ai癥樣本中ctDNA羥甲基化分布和水平。本文通過ctDNA羥甲基化檢測技術,在全基因組范圍內,檢測ai癥與健康人中ctDNA羥甲基化的水平。檢測的ai癥類型包括腸ai,胃ai,胰腺ai,肝ai,甲狀腺ai,檢測組織類型包括ai癥及ai旁組織,血漿和白血球。結果發現,5hmC主要分布在基因組的轉錄活性區,可能與開放染色質和允許組蛋白修飾相關。同時,5hmC對特定ai癥類型高敏感,如腸ai和胃ai??偟膩碚f,ctDNA羥甲基化檢測為日后僅通過血漿樣本進行無創診斷奠定了良好的基礎。
    不同類型疾病中,ctDNA羥甲基化可用于分子標志物研究
    圖1. 不同類型疾病中,ctDNA羥甲基化可用于分子標志物研究
     ctDNA羥甲基化可區分組織類型
    圖2. ctDNA羥甲基化可區分組織類型   
     在腸癌和健康組中,單個基因羥甲基化水平的一致性很高
    圖3. 在腸ai和健康組中,單個基因羥甲基化水平的一致性很高
    腸癌的不同分期中,ctDNA羥甲基化水平不同
    圖4. 腸ai的不同分期中,ctDNA羥甲基化水平不同
    胃癌及腸癌的ctDNA羥甲基化檢出率很高
    圖5. 胃ai及腸ai的ctDNA羥甲基化檢出率很高

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