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    表觀遺傳學研究
    CUT&Tag:新一代ChIP-Seq技術
    日期:2020年05月18日    來源:云序生物

    技術簡介

    CUT&TagCleavage Under Targets and Tagmentation是蛋白質-DNA互作關系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技術,適用于無ChIP級別抗體的蛋白研究。與傳統的ChIP-Seq研究方法相比,該技術無需交聯、超聲打斷、末端抹平和接頭連接等操作,因此具有省時高 效、所需的樣品量少、背景信號低可重復性好等優點,甚至可用于單細胞水平測序。CUT&Tag有望將蛋白質-DNA互作的研究變成一種類似PCR反應的常規操作,對基因調控、表觀遺傳等領域的研究具有革命性的意義。

    產品優勢

       樣品起始量低:能夠對及少量樣品進行分析

       無需ChIP級別抗體:無需提供ChIP級別抗體

       性價比高背景噪音低,所需測序深度少

       實驗重復性好實驗重復結果一致性好

    技術原理

    ChiTagProtein A蛋白與Tn5轉座酶的融合蛋白,當抗體結合目的蛋白(如轉錄因子、組蛋白等)后,Protein A蛋白可直接結合抗體,攜帶的Tn5轉座酶可特異性的切割目的蛋白附近的DNA片段,并將DNA片段連上接頭,文庫構建之后進行高通量測序。 

    CUT&Tag實驗流程

    圖注:云序生物CUT&Tag實驗流程

    樣本要求

    1)樣品類型:細胞、組織,其它樣品信息請詳詢

    2)樣品量

    細胞:5×105

    組織:5mg

    3)樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊,液氮凍存后,-80℃ 保存。

    4)樣品運輸:干冰運輸。

    案例解析

    CUT&Tag技術研究蛋白質-DNA互作的優勢

    原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells

    期刊:Nature Communications 發表時間:20190429 影響因子: 11.878

    在生物學研究中,DNA與蛋白質之間的互作是至關重要的,參與基因的表達、調控、復制、重組和修復以及RNA的轉運、翻譯和調控等多個過程,幾乎涉及所有的生命活動。目前研究兩者互作的方法很多,作者選擇了傳統的研究手段ChIP-seq,優化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究組蛋H3K27me3。通過比對實驗結果,發現CUT&Tag有相當低的背景噪聲以及極強的信號。通過對H3K4me1修飾物進行分析,顯示CUT&Tag的靈敏度極高,實驗可重復性極好。 

    CUT&Tag方法的優點

    1. CUT&Tag方法的優點

     

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