環狀DNA簡介
游離于染色體基因組之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被發現常常以環狀的形式存在，這種形式的DNA被稱為eccDNA (extrachromosomal circular DNA）。目前也習慣將巨大的環狀DNA(>1Mb)稱為ecDNA, 而將相對較小的環狀DNA稱為eccDNA。
傳統觀點認為真核基因組通常形成穩定的線性染色體。但**的研究表明：無論是在正常體細胞還是*細胞中，都存在大量染色體外環狀DNA。近日，Nature雜志上發表了顛覆性研究成果：在**中，主要的*基因轉錄本是直接來自于環狀DNA的，而環狀DNA的染色質是高度開放的，環狀DNA的*基因能夠大量表達，同時缺乏絲粒，導致不遵照孟德爾定律進行遺傳，這種特性使得環狀DNA是驅動**異質性的重要機制。由此可見，由于其結構和表達的特異性，環狀DNA可以影響細胞生命活動，促進**細胞演進和適應性進化，增加了基因組的可塑性和不穩定性。目前，環狀DNA不**可以作為一種新型特異的**標志物，還在**發**展機理研究中發揮著重大的潛在價值?？梢灶A見的是，環狀DNA將迅速成為新的科研熱點，甚至會對傳統遺傳學和基因組學帶來**性影響。

技術簡介
游離于染色體基因組之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被發現常常以環狀的形式存在，這種形式的DNA被稱為環狀DNA (extrachromosomal circular DNA）。目前也習慣將巨大的環狀DNA(>1Mb)稱為ecDNA，而將相對較小的環狀DNA稱為eccDNA。
環狀DNA連登《Nature》《Cell》等**期刊，徹底顛覆了人們對基因遺傳的傳統認知，成為了**潛力的科研新熱點。云序生物環狀DNA甲基化測序技術基于轉座酶和m5C位點酶學轉化方法，用核酸外切酶V消化以去除線性DNA。通過轉座酶打開環狀DNA的環形結構，并在DN**段的兩端加上接頭。通過Klenow酶修復轉座產物的末端缺口。通過溫和的酶轉化法，將未甲基化的胞嘧啶（C）高效地轉化為尿嘧啶（U），后續進行文庫構建與高通量測序，從而獲得發生甲基化修飾的環狀DNA，雙端測序，上機測序數據量24G。該技術可以同時檢測環狀DNA和環狀DNA的甲基化修飾狀態，為環狀DNA的深入研究及新型分子標志物的開發提供了新的技術手段。
云序優勢
適用于微量體液樣品：
客戶只需提供血清、血漿、尿液、腦脊液等體液，云序生物為您完成從樣品準備、環狀DNA富集、文庫制備、上機測序到數據分析整套服務流程。
一箭雙雕的結果：
同時檢測環狀DNA及其甲基化狀況，節約樣品，性價比高。
專業的生物信息學分析：
專業的生物信息學團隊，開發了高效識別分析環狀DNA的算法，且能單堿基分辨甲基化修飾位點，滿足客戶的各類深入數據分析需求。

樣本要求

樣品類型：
血清、血漿、尿液、腦脊液。
樣品量：
血清、血漿：5mL
尿液：5-10mL
腦脊液: 5mL
樣品運輸及保存：
樣品干冰運輸。血漿需使用EDTA抗凝管（綠色蓋子抗凝管），勿用肝素管取樣。


數據分析
1.環狀DNA的識別及甲基化水平

2.環狀DNA的基因注釋

3.環狀DNA長度分布圖

4.環狀DNA甲基化水平統計

案例解析
案例1：孕婦血漿中胎兒環狀DNA 的特征是：呈甲基化狀態以及被**
原文：Characteristics of Fetal Extrachromosomal Circular DNA in Maternal Plasma: Methylation Status and Clearance
期刊：Clinical Chemistry 影響因子：8.322
近期，NIPT之父盧煜明教授團隊開發了一種環狀DNA 甲基化分析的測序方案，通過對不同產后時間點的胎兒環狀DNA含量的評估，研究了胎兒環狀DNA的體外**效率。作者還發現血漿中的胎兒 環狀DNA 與母體 環狀DNA 相比甲基化程度相對較低。此外，和胎兒線性DNA類似，胎兒環狀DNA在分娩后從母血中迅速**?？傊?，該團隊基于轉座酶和m5C位點酶學轉化方法開發出了環狀DNA甲基化測序技術，并揭示了孕婦血漿中的胎兒環狀DNA甲基化狀況，為環狀DNA的深入研究及新型分子標志物的開發提供了新的技術手段。