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    環狀RNA研究
    環狀RNA實時定量PCR
    日期:2018年06月08日    來源:
    技術簡介
    環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類新型非編碼RNA分子,它在真核生物中的大量存在顛覆了傳統的線性RNA觀點,成為近兩年來RNA領域中炙手可熱新星。環狀RNA的表達具有組織和疾病特異性,與組織發育和疾病發生 發展密切相關。此外,環狀RNA比線性RNA更穩定,可作為新型疾病分子標志物。 
    實時定量RT-PCR是檢測RNA表達的金標準,但環狀RNA的實時定量PCR檢測存在著特殊的挑戰:1). 環狀RNA為閉合環形結構,只有采取Outward-facing primer設計策略才能把它們和線性RNA區分開;2). 沒有環狀RNA的序列數據庫,很難獲取其序列信息;為了促進環狀RNA的研究,云序生物全新推出了環狀RNA實時定量PCR技術服務。
    云序生物環狀RNA實時定量 PCR服務流程:
    云序生物提供一站式環狀RNA實時定量PCR技術服務,包括:RNA抽提,RNA質控,環狀RNA特異性引物設計,環狀RNA逆轉錄,環狀RNA qPCR檢測。并提供詳細的實驗報告和實驗數據。


    云序生物環狀RNA實時定量 PCR服務流程: 

    云序優勢
    1). “Outward-facing”引物設計策略
    云序生物針對環狀RNA特異性的backsplice位點,采用了outward-facing引物設計策略:針對線性RNA,primer 1和primer 2是尾對尾,無法有效擴增;而如果線性RNA的外顯子1和3收尾相連形成了閉合的環狀RNA, primer 1和2就可以擴增出針對特異性backsplice位點的產物,從而特異性的檢測環狀RNA。

    “Outward-facing”引物設計策略 

    2). 預驗證的引物
    云序生物根據權威文獻和數據庫整理了數萬個人類和小鼠環狀RNA,預設計了它們的PCR引物,并對其中一些常見的環狀RNA在組織和細胞系中進行了預驗證。從而幫客戶節省了大量引物設計和測試的時間,并保證了實驗的成功。
    樣本要求
    細胞,新鮮組織,血清血漿,石蠟包埋樣品,抽提好的RNA。


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